代谢通道

doi：10.18129/b9.bioc.METABOANTONTATION

这是发展代谢文字的版本；对于稳定版本，请参阅代谢通道。

代谢组学注释的实用程序

生物导体版本：开发（3.16）

高级功能以帮助（代谢组学）数据集注释。这些功能包括基于质量匹配的简单暂定注释的功能，但还可以考虑M/z和保留时间的LC-MS特征的保留时间。此外，该功能提供了高级功能，以简化LC-MS/MS光谱与光谱库，对象以及功能的匹配，以表示和管理此类匹配的数据。

作者：迈克尔·威特（Michael Witting）[AUT]，约翰内斯·雷纳[AUT，CRE]，Andrea Vicini [aut]，Carolin Huber [AUT]

维护者：约翰内斯·雷纳（Johannes Rainer）

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ metaboantation”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“代谢通道”）

html	R脚本	基于MS的代谢组学数据的注释
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	基础设施，，，，质谱，，，，代谢组学，，，，软件
版本	1.1.2
在生物导体中	Bioc 3.15（R-4.2）（<6个月）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 4.0.0）
进口	生物基因，，，，mscoreutils，，，，代谢核心，，，，蛋白质， 方法，S4VECTORS，，，，光谱（> = 1.5.7），生物比较，，，，总结性特征，，，，qfeatures，图形
链接
建议	测试，，，，尼特，，，，MSDATA，，，，生物使用，，，，rmarkDown，，，，情节，，，，闪亮的，，，，Shinyjs，，，，DT
系统要求
增强
URL	https://github.com/rformassspectrometry/metaboannotation
BugReports	https://github.com/rformassspectrometry/metaboannotation/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	metaboantation_1.1.2.tar.gz
Windows二进制	paboantation_1.1.2.zip
MacOS 10.13（高山脉）	MetaBoAnnotation_1.1.2.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metaboannotation
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：套餐/pemaboannotation
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/metaboannotation/
软件包下载报告	下载统计