HiContacts

DOI:10.18129 / B9.bioc.HiContacts

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅HiContacts

HiContacts: R界面很酷的文件

Bioconductor版本:3.16

HiContacts: R接口(m)酷文件和其他高c处理的文件格式。HiContacts提供了一个工具来分析和可视化高c数据集的集合。它可以从对导入数据或(m)酷文件。

作者:雅克Serizay (aut (cre)

维护人员:雅克Serizay < jacquesserizay gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“HiContacts”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“HiContacts”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“HiContacts”)

HTML R脚本 介绍HiContacts
PDF 参考手册
文本 许可证

细节

biocViews DNA3DStructure,DataImport,,软件
版本 1.0.0
Bioconductor自 BioC 3.16 (r - 4.2)(< 6个月)
许可证 麻省理工学院+文件许可证
取决于 R (> = 4.2)
进口 HiContactsData,InteractionSet,GenomicInteractions,GenomicRanges,IRanges,GenomeInfoDb,S4Vectors,BiocGenerics、方法、rhdf5、矩阵、小宠物猫、tidyr dplyr,胶水,stringr,网状,ggplot2, ggrastr,鳞片
链接
建议 cowplot testthat (> = 3.0.0),BiocStyle、knitr rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/js2264/HiContacts
BugReports https://github.com/js2264/HiContacts/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包 HiContacts_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 HiContacts_1.0.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64) HiContacts_1.0.0.tgz
macOS二进制(arm64) HiContacts_1.0.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HiContacts
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ HiContacts
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/HiContacts/
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/HiContacts/
包下载报告 下载数据

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