这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅HiContacts。
Bioconductor版本:3.16
HiContacts: R接口(m)酷文件和其他高c处理的文件格式。HiContacts提供了一个工具来分析和可视化高c数据集的集合。它可以从对导入数据或(m)酷文件。
维护人员:雅克Serizay < jacquesserizay gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“HiContacts”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“HiContacts”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“HiContacts”)
HTML | R脚本 | 介绍HiContacts |
参考手册 | ||
文本 | 许可证 |
biocViews | DNA3DStructure,DataImport,嗝,软件 |
版本 | 1.0.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.16 (r - 4.2)(< 6个月) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | R (> = 4.2) |
进口 | HiContactsData,InteractionSet,GenomicInteractions,GenomicRanges,IRanges,GenomeInfoDb,S4Vectors,BiocGenerics、方法、rhdf5、矩阵、小宠物猫、tidyr dplyr,胶水,stringr,网状,ggplot2, ggrastr,鳞片 |
链接 | |
建议 | cowplot testthat (> = 3.0.0),BiocStyle、knitr rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/js2264/HiContacts |
BugReports | https://github.com/js2264/HiContacts/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
源包 | HiContacts_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | HiContacts_1.0.0.zip(64位) |
macOS二进制(x86_64) | HiContacts_1.0.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | HiContacts_1.0.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HiContacts |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ HiContacts |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/HiContacts/ |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/HiContacts/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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