MWASTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.MWASTools

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MWASTools。

MWASTools:一个集成的管道执行metabolome-wide关联研究

Bioconductor版本:3.16

MWASTools执行metabolome-wide关联研究提供了一个完整的管道。包装的主要功能包括:质量控制分析metabonomic数据;mwa使用不同的关联模型(部分相关性;广义线性模型);使用非参数引导模型验证;的可视化mwa结果;使用STOCSY NMR代谢物鉴定;和生物mwa结果的解释。

作者:安德里亚·Rodriguez-Martinez约兰m . Posma拉斐尔•阿亚拉安娜l .七巧板Maryam安瓦尔,杰里米·k·尼科尔森Marc-Emmanuel杜马斯

维护人员:安德里亚Rodriguez-Martinez <安德里亚。rodriguez-martinez13 imperial.ac。英国>,拉斐尔Ayala <拉斐尔。阿亚拉在oist.jp >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MWASTools”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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HTML	R脚本	MWASTools
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	Cheminformatics,Lipidomics,代谢组学,质量控制,软件,SystemsBiology
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(6年)
许可证	CC BY-NC-ND 4.0
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	glm2 ppcor,qvalue、汽车、引导、网格、ggplot2 gridExtra, igraph,SummarizedExperiment,KEGGgraphRCurl,KEGGREST,ComplexHeatmap统计,跑龙套
链接
建议	RUnit,BiocGenericsknitr,BiocStyle,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	MetaboSignal
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	MWASTools_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	MWASTools_1.22.0.zip
macOS二进制(x86_64)	MWASTools_1.22.0.tgz
macOS二进制(arm64)	MWASTools_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MWASTools
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MWASTools
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MWASTools/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MWASTools/
包下载报告	下载数据