SeqVarTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.SeqVarTools

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SeqVarTools。

工具变量数据

Bioconductor版本:3.16

一个接口的快速访问存储格式VCF SeqArray提供的数据,与常见的操作和分析的工具。

作者:斯蒂芬妮·m·Gogarten Xiuwen郑,艾德丽安Stilp

维护人员:斯蒂芬妮·m·Gogarten < sdmorris uw.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SeqVarTools”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SeqVarTools”)

PDF	R脚本	介绍SeqVarTools
PDF	R脚本	迭代器在SeqVarTools
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneticVariability,遗传学,单核苷酸多态性,测序,软件
版本	1.36.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(9.5年)
许可证	GPL-3
取决于	SeqArray
进口	grDevices、图形、数据、方法、Biobase,BiocGenerics,gdsfmt,GenomicRanges,IRanges,S4Vectors,logistf GWASExactHW矩阵,data.table
链接
建议	BiocStyleRUnit, stringr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/smgogarten/SeqVarTools
取决于我
进口我	《创世纪》,VariantExperiment
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	SeqVarTools_1.36.0.tar.gz
Windows二进制	SeqVarTools_1.36.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	SeqVarTools_1.36.0.tgz
macOS二进制(arm64)	SeqVarTools_1.36.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SeqVarTools
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SeqVarTools
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/SeqVarTools/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SeqVarTools/
包下载报告	下载数据