bandle

DOI:10.18129 / B9.bioc.bandle

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅bandle。

R包微分的贝叶斯分析亚细胞定位实验

Bioconductor版本:3.16

Bandle包使微分本地化实验的分析和可视化质谱仪使用数据。实验方法支持包括动态LOPIT-DC hyperLOPIT、动态Organellar地图、动态卡式肺囊虫肺炎。它提供了Bioconductor基础设施来分析这些数据。

作者:奥利弗·m·克鲁克(aut (cre)丽莎Breckels (aut)

维修工:奥利弗·m·克鲁克<奥利弗。骗子在stats.ox.ac.uk >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“bandle”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“bandle”)

HTML	R脚本	分析微分本地化实验BANDLE:小插图1
HTML	R脚本	分析差动本地化与BANDLE实验:小插图2
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	贝叶斯,分类,聚类,DataImport,ImmunoOncology,MassSpectrometry,蛋白质组学,质量控制,软件
版本	1.2.2
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.1),S4Vectors,Biobase,MSnbase,pRoloc
进口	Rcpp (> = 1.0.4.6),pRolocdata,ggplot2 lbfgs dplyr、plyr knitr,方法,BiocParallelrobustbase,BiocStyle,ggrepel ggalluvial tidyr circlize,图形、属性、跑龙套,grDevices rlang
链接	Rcpp RcppArmadillo,黑洞
建议	coda (> = 0.19 4)、testthat插值函数,字段,pheatmap,冬青,rmarkdown、拼写
SystemRequirements
增强了
URL	http://github.com/ococrook/bandle
BugReports	https://github.com/ococrook/bandle/issues
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	bandle_1.2.2.tar.gz
Windows二进制	bandle_1.2.2.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	bandle_1.2.2.tgz
macOS二进制(arm64)	bandle_1.2.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bandle
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ bandle
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/bandle/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/bandle/
包下载报告	下载数据