epistasisGA

DOI:10.18129 / B9.bioc.epistasisGA

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅epistasisGA。

R包识别multi-snp核心家庭的影响研究使用产品的方法

Bioconductor版本:3.16

这个包运行设备的方法来识别上位性效应在核心家庭的研究。它还提供了函数permutation-based推理和图形的可视化结果。

作者:迈克尔Nodzenski (aut (cre),朱诺Krahn(施)

维护人员:迈克尔Nodzenski <迈克尔。在gmail.com nodzenski >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“epistasisGA”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“epistasisGA”)

HTML	R脚本	设备使用情况
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneticVariability,遗传学,单核苷酸多态性,软件
版本	1.0.2中
Bioconductor自	BioC 3.16 (r - 4.2)(< 6个月)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.0)
进口	BiocParallel、数据。表、matrixStats统计、生存、igraph batchtools, qgraph, grDevices,平行,Rcpp(> = 0.11.0)它,ggplot2,网格,图形,跑龙套
链接	Rcpp, RcppArmadillo
建议	矩阵,BiocStyle,rmarkdown knitr magrittr、kableExtra testthat (> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/mnodzenski/epistasisGA
BugReports	https://github.com/mnodzenski/epistasisGA/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	epistasisGA_1.0.2.tar.gz
Windows二进制	epistasisGA_1.0.2.zip
macOS二进制(x86_64)	epistasisGA_1.0.2.tgz
macOS二进制(arm64)	epistasisGA_1.0.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epistasisGA
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ epistasisGA
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/epistasisGA/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/epistasisGA/
包下载报告	下载数据