qsvaR

DOI:10.18129 / B9.bioc.qsvaR

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅qsvaR。

为降解生成质量替代变量分析修正

Bioconductor版本:3.16

qsvaR包包含函数删除degration rna-seq数据的影响从死亡的脑组织。包装备来帮助用户生成主成分与降解有关。差异表达分析中使用的组件可以消除降解的影响。

作者:约书亚Stolz (aut (cre)列奥纳多·达·芬奇Collado-Torres(施)

维护人员:约书亚Stolz <乔希。在libd.org stolz >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“qsvaR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“qsvaR”)

HTML	R脚本	介绍qsvaR
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BiologicalQuestion,报道,DifferentialExpression,归一化,测序,软件,WorkflowStep
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.2),SummarizedExperiment
进口	股东价值分析,ggplot2统计方法
链接
建议	BiocFileCache,BiocStylecovr knitr,limma,rmarkdown RefManageR sessioninfo testthat (> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/LieberInstitute/qsvaR
BugReports	https://support.bioconductor.org/t/qsvaR
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	qsvaR_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	qsvaR_1.2.0.zip
macOS二进制(x86_64)	qsvaR_1.2.0.tgz
macOS二进制(arm64)	qsvaR_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qsvaR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ qsvaR
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/qsvaR/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/qsvaR/
包下载报告	下载数据