rrvgo

DOI:10.18129 / B9.bioc.rrvgo

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅rrvgo。

减少+想象去

Bioconductor版本:3.16

减少和可视化基因本体术语列表通过识别redudance基于语义相似度。

作者:塞尔吉Sayols (aut (cre)

维护人员:塞尔吉Sayols < sergisayolspuig gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“rrvgo”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“rrvgo”)

HTML	R脚本	使用rrvgo
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	注释,聚类,去,网络,通路,软件
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(3年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	GOSemSim,AnnotationDbi,GO.db,ggplot2 pheatmap ggrepel treemap, tm, wordcloud,闪亮,grDevices,电网数据,方法,umap
链接
建议	knitr rmarkdown,BiocStyleshinydashboard testthat(> =魅惑,DT,阴谋,热图,magrittr,跑龙套,clusterProfiler,剂量大满贯,org.Ag.eg.db,org.At.tair.db,org.Bt.eg.db,org.Ce.eg.db,org.Cf.eg.db,org.Dm.eg.db,org.Dr.eg.db,org.EcK12.eg.db,org.EcSakai.eg.db,org.Gg.eg.db,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Mmu.eg.db,org.Pt.eg.db,org.Rn.eg.db,org.Sc.sgd.db,org.Ss.eg.db,org.Xl.eg.db
SystemRequirements
增强了
URL	//www.andersvercelli.com/packages/rrvgohttps://ssayols.github.io/rrvgo/index.html
取决于我
进口我
建议我	genekitr
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	rrvgo_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	rrvgo_1.10.0.zip
macOS二进制(x86_64)	rrvgo_1.10.0.tgz
macOS二进制(arm64)	rrvgo_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rrvgo
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rrvgo
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/rrvgo/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/rrvgo/
包下载报告	下载数据