三轮车

DOI:10.18129 / B9.bioc.tricycle

这个包是3.16版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅三轮车。

细胞周期的三轮车:可转让的表示和推理

Bioconductor版本:3.16

包包含函数来推断和想象细胞周期进程使用单细胞RNASeq数据。它利用转移学习的想法,预测新数据之前的学习生物可判断的空间。我们提供一个pre-learned细胞周期空间,这可以用来推断出人类和小鼠的细胞周期时间单一细胞样本。此外,我们还提供函数可视化细胞周期时间不同的嵌入和函数来建立新的参考。

作者:郑诗杰(aut (cre)

维护人员:运输郑< shijieczheng gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“三轮车”)

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文档

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HTML	R脚本	细胞周期的三轮车:可转让的表示和推理
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细节

biocViews	BiologicalQuestion,DimensionReduction,ImmunoOncology,RNASeq,SingleCell,软件,转录,转录组
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.0),SingleCellExperiment
进口	方法、圆形ggplot2 ggnewscale,AnnotationDbi,嘘,GenomicRanges,IRanges,S4Vectors,dplyr scattermore RColorBrewer grDevices,统计数据,SummarizedExperiment,跑龙套
链接
建议	testthat (> = 3.0.0),BiocStyle,rmarkdown knitr CircStats、cowplot htmltools,修拉,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/hansenlab/tricycle
BugReports	https://github.com/hansenlab/tricycle/issues
取决于我
进口我
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	tricycle_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	tricycle_1.6.0.zip
macOS二进制(x86_64)	tricycle_1.6.0.tgz
macOS二进制(arm64)	tricycle_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tricycle
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/三轮车
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/tricycle/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/tricycle/
包下载报告	下载数据