咆哮

DOI:10.18129 / B9.bioc.bluster

生物导体的聚类算法

Bioconductor版本:Release (3.16)

将常见的聚类算法封装在一个易于扩展的S4框架中。后端实现了分层、k-means和基于图的聚类。还提供了几个实用程序来比较和评估聚类结果。

作者:Aaron Lun [aut, cre]， Stephanie Hicks [ctb]

维护者:Aaron Lun

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.2")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("bluster")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“咆哮”)

超文本标记语言	R脚本	1.聚类算法
超文本标记语言	R脚本	2.聚类诊断
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类，GeneExpression，ImmunoOncology，SingleCell，软件，转录组
版本	1.8.0
在Bioconductor中	BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	统计，方法，utils，集群，矩阵，Rcpp，igraph，S4Vectors，BiocParallel，BiocNeighbors
链接	Rcpp
建议	knitr，rmarkdown，testthat，BiocStyle，dynamicTreeCut，scRNAseq，天窗，嘘，食物，pheatmap，冬青，mbkmeans，kohonen，apcluster
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL
这取决于我	OSCA。先进,OSCA。基础，OSCA，介绍，OSCA。multisample OSCA。工作流,SingleRBook
进口我	scDblFinder，食物，“航行者”号
建议我	后面;，ChromSCape，dittoSeq，mbkmeans，mumosa
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	bluster_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	bluster_1.8.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	bluster_1.8.0.tgz
macOS二进制(arm64)	bluster_1.8.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bluster
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bluster
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/bluster/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/bluster/
软件包下载报告	下载数据