dcanr

DOI:10.18129 / B9.bioc.dcanr

微分co-expression /协会网络分析

Bioconductor版本:版本(3.16)

这个包实现方法和评估框架来推断微分co-expression /协会网络。各种方法实现,可以评估使用模拟数据集。推理的微分co-expression网络可以识别网络之间改变两个条件(例如,健康和疾病)。

作者:Dharmesh d Bhuva (aut (cre)

维护人员:Dharmesh d Bhuva < Bhuva。d wehi.edu.au >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“dcanr”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“dcanr”)

HTML	R脚本	1。微分co-expression分析
HTML	R脚本	2。直流法评价
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GraphAndNetwork,网络,NetworkInference,软件
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(4年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.6.0)
进口	igraph,foreach,plyr,stringr,reshape2、方法、矩阵、图表、数据、RColorBrewer,circlize,doRNG
链接
建议	EBcoexpress,testthat,EBarrays,GeneNet,mclust,minqa,SummarizedExperiment,Biobase,knitr,rmarkdown,BiocStyle,刨边机
SystemRequirements
增强了	平行,doSNOW,doParallel
URL	https://davislaboratory.github.io/dcanr/https://github.com/DavisLaboratory/dcanr
BugReports	https://github.com/DavisLaboratory/dcanr/issues
取决于我
进口我	SingscoreAMLMutations
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	dcanr_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	dcanr_1.14.0.zip
macOS二进制(x86_64)	dcanr_1.14.0.tgz
macOS二进制(arm64)	dcanr_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dcanr
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ dcanr
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/dcanr/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/dcanr/
包下载报告	下载数据