metapod

DOI:10.18129 / B9.bioc.metapod

差异分析p值的元分析

Bioconductor版本:Release (3.16)

实现了多种方法组合p值在基因组规模数据集的差异分析。函数可以结合同一分析中不同测试的p值(例如，ChIP-seq中的基因组窗口，RNA-seq中的外显子)或跨单独分析的相应测试(例如，重复比较，不同处理条件的影响)。支持处理对数转换的输入p值、缺失值和适当的加权。

作者:Aaron Lun [aut, cre]

维护者:Aaron Lun

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.2")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("metapod")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“metapod”)

超文本标记语言	R脚本	荟萃分析策略
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialPeakCalling，MultipleComparison，软件
版本	1.6.0
在Bioconductor中	BioC 3.13 (R-4.1)(2年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	Rcpp
链接	Rcpp
建议	testthat，knitr，BiocStyle，rmarkdown
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL
这取决于我
进口我	csaw，mumosa，食物
建议我	TSCAN
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	metapod_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	metapod_1.6.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	metapod_1.6.0.tgz
macOS二进制(arm64)	metapod_1.6.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metapod
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/metapod
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/metapod/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/metapod/
软件包下载报告	下载数据