生物导体工作流程包
生物导体版本：开发（3.16）
| 包裹 | 维护者 | 标题 |
|---|---|---|
| 注解 | 生物导体封装维护器 | 基因组注释资源 |
| 数组 | 生物导体封装维护器 | 使用生物导体进行微阵列分析 |
| Biocmetaworkflow | 迈克·史密斯 | 关于发布Bioc工作流程的BIOC工作流程 |
| BP4RNASEQ | Shanwen Sun | 保姆的包装，用于可再现的RNA序列分析 |
| CageWorkFlow | 马尔特·托伯格（Malte Thodberg） | 使用R/Bioconductor分析CAGE数据的分步指南 |
| chipseqdb | 亚伦·伦 | 生物导体工作流以检测芯片序列数据中的差异结合 |
| csawusersguide | 亚伦·伦 | CSAW用户指南 |
| CytofworkFlow | 马克·罗宾逊 | CYTOF工作流程：高通量高维细胞仪数据集中的差分发现 |
| EGSEA123 | 马修·里奇（Matthew Ritchie） | 易于有效的合奏基因集测试与EGSEA |
| Exphuntersuite | 詹姆斯·珀金斯 | 用于全面分析转录组数据的软件包 |
| 表达式正式工作流 | Karthikeyan Murugesan | 基因表达归一化工作流程 |
| 氟化物学 | 斯图尔特·李 | plyranges和tximeta工作流程 |
| 结肠管制 | 生物导体封装维护器 | 通过序列匹配找到已知转录因子的候选结合位点 |
| GEOMXWORKFLOWS | 杰森·里夫斯（Jason Reeves） | GEOMX数字空间分析师（DSP）数据分析工作流程 |
| 高通量库 | 生物导体封装维护器 | 使用具有高吞吐量测定的生物导体 |
| 举起 | 生物导体封装维护器 | 用Rtracklayer更改基因组坐标系:: Liftover |
| Maendtoend | Stefanie Reisenauer | 使用Affymetrix微阵列的差分基因表达的端到端工作流程 |
| 甲基化arrayAnalysy | Jovana Maksimovic | 用于分析甲基化阵列数据的交叉包装生物导体工作流程。 |
| recountworkflow | 伦纳多·科拉多 - 托雷斯 | 重新计算工作流程：使用生物导体访问70,000多个人RNA-seq样品 |
| RNASEQ123 | 马修·里奇（Matthew Ritchie） | RNA-seq分析很容易作为1-2-3，具有Limma，Glimma和Edger |
| rnaseqdtu | 迈克尔·洛夫 | 鲑鱼定量后，用于差分转录本的RNA-SEQ工作流程 |
| rnaseqgene | 迈克尔·洛夫 | RNA-Seq工作流程：基因级探索性分析和差异表达 |
| rnaseqgeneedgerql | 云陈陈 | 基因级RNA-SEQ差异表达和途径分析使用RSUBREAD和EDGER准型管道 |
| 测序 | 生物导体封装维护器 | 序列数据生物导体简介 |
| Simplesinglecell | 亚伦·伦 | 分步工作流，用于使用生物导体对单细胞RNA-seq数据进行低水平分析 |
| singscoreamlmutations | Dharmesh D. Bhuva | 使用singscore来预测转录组特征中AML中的突变 |
| tcgaworkflow | Tiago Chedraoui Silva | TCGA工作流使用生物导管包分析癌症基因组学和表观基因组学数据 |
| 变体 | 生物导体封装维护器 | 注释基因组变体 |
2021年欧洲杯 包»
生物导体稳定的半年度发布：
生物导体（（r）版本：
- 3.13（4.1）
- 3.13（4.1）
- 3.12（4.0）
- 3.11（4.0）
- 3.10（3.6）
- 3.9（3.6）
- 3.8（3.5）
- 3.7（3.5）
- 3.6（3.4）
- 3.5（3.4）
- 3.4（3.3）
- 3.3（3.3）
- 3.2（3.2）
- 3.1（3.2）
- 3.0（3.1）
- 2.14（3.1）
- 2.13（3.0）
- 2.12（3.0）
- 2.11（2.15）
- 2.10（2.15）
- 2.9（2.14）
- 2.8（2.13）
- 2.7（2.12）
- 2.6（2.11）
- 2.5（2.10）
- 2.4（2.9）
- 2.3（2.8）
- 2.2（2.7）
- 2.1（2.6）
- 2.0（2.5）
- 1.9（2.4）
- 1.8（2.3）
- 1.7（2.2）
- 1.6（2.1）
发布公告。
