CNORfeeder

DOI:10.18129 / B9.bioc.CNORfeeder

这是发展CNORfeeder版本;稳定的发布版本,请参阅CNORfeeder。

整合CellNOptR添加缺失的链接

Bioconductor版本:发展(3.17)

这个包literature-constrained集成和数据驱动的方法来推断从扰动信号网络实验。它允许扩展给定网络链接来源于数据通过各种推理方法和使用信息的物理相互作用蛋白质指导和验证链接的集成。

作者:Federica Eduati (aut) Enio Gjerga[所有],阿提拉伽柏(cre)

维护人员:<匈奴王阿提拉伽柏。伽柏在uni-heidelberg.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“CNORfeeder”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“CNORfeeder”)

PDF	R脚本	主要装饰图案:使用CNORfeeder玩网络
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays,CellBiology,NetworkInference,蛋白质组学,软件
版本	1.39.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(10年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.6.0),CellNOptR(> = 1.4.0),图
进口
链接
建议	minetcatnet,Rgraphviz,RUnit,BiocGenerics,igraph
SystemRequirements
增强了	MEIGOR
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	CNORfeeder_1.39.0.tar.gz
Windows二进制	CNORfeeder_1.39.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	CNORfeeder_1.39.0.tgz
macOS二进制(arm64)	CNORfeeder_1.39.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CNORfeeder
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CNORfeeder
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/CNORfeeder/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CNORfeeder/
包下载报告	下载数据