Bioconductor版本:版本(3.17)
包解析Affymetrix文件(CDF,玻璃纸,共和人民党,BPMAP, BAR)。它提供了快速和内存高效方法解析Affymetrix文件使用Affymetrix融合的SDK。ASCII和基于二进制的文件支持。目前,有方法阅读芯片定义文件(CDF)和细胞强度文件(移动电话)。这些文件可以读取全部或部分。例如,探针信号从几probesets可以很快从一个组移动电话文件提取到一个方便的列表结构。
作者:亨利克·本特松(aut),布拉德(aut),罗伯特先生[所有],Kasper丹尼尔•汉森(aut (cre)吉姆·海丝特(施),马丁·摩根(施)
维修工:Kasper丹尼尔·汉森< kasperdanielhansen gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“affxparser”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“affxparser”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,基础设施,微阵列,OneChannel,ProprietaryPlatforms,软件 |
版本 | 1.72.0 |
Bioconductor自 | BioC 1.7 (r - 2.2)(18岁) |
许可证 | LGPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 2.14.0) |
进口 | |
链接 | |
建议 | R。oo (> = 1.22.0), R。跑龙套(> = 2.7.0),AffymetrixDataTestFiles |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/HenrikBengtsson/affxparser |
BugReports | https://github.com/HenrikBengtsson/affxparser/issues |
取决于我 | 斜体,pdInfoBuilder |
进口我 | affyILM,cn.farms,crossmeta,EventPointer,GCSscore,GeneRegionScan,斜体,益生元 |
建议我 | 锡 |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
源包 | affxparser_1.72.0.tar.gz |
Windows二进制 | affxparser_1.72.0.zip(64位) |
macOS二进制(x86_64) | affxparser_1.72.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | affxparser_1.72.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affxparser |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ affxparser |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/affxparser/ |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/affxparser/ |
包下载报告 | 下载数据 |
文档»
Bioconductor