metabolomicsWorkbenchR

DOI:10.18129 / B9.bioc.metabolomicsWorkbenchR

这是发展metabolomicsWorkbenchR版本;稳定版请参见metabolomicsWorkbenchR．

代谢组学工作台在R

Bioconductor版本:开发(3.17)

这个包提供了与Metabolomics Workbench RESTful API接口的函数。研究，化合物，蛋白质和基因信息可以使用API搜索。还包括在常见的生物导体格式中获取研究数据的方法，如summarizeexperiment和MultiAssayExperiment。

作者:加文·里斯·劳埃德[aut, cre]，拉尔夫·约翰内斯·玛丽亚·韦伯[aut]

维护者:Gavin Rhys Lloyd

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("metabolomicsWorkbenchR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“metabolomicsWorkbenchR”)

超文本标记语言	R脚本	使用structToolbox的示例
超文本标记语言	R脚本	Introduction_to_metabolomicsWorkbenchR
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	代谢组学，软件
版本	1.9.0
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.0)
进口	data.table，httr，jsonlite、方法、MultiAssayExperiment，结构体，SummarizedExperiment,跑龙套
链接
建议	BiocStyle，covr，knitr，HDF5Array，rmarkdown，structToolbox，testthat，pmp、网格png
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	fobitools
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	metabolomicsWorkbenchR_1.9.0.tar.gz
Windows二进制	metabolomicsWorkbenchR_1.9.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	metabolomicsWorkbenchR_1.9.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	metabolomicsWorkbenchR_1.9.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metabolomicsWorkbenchR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/metabolomicsWorkbenchR
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/metabolomicsWorkbenchR/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/metabolomicsWorkbenchR/
软件包下载报告	下载数据