HelloRanges

DOI:10.18129 / B9.bioc.HelloRanges

这是发展HelloRanges版本;稳定的发布版本,请参阅HelloRanges。

介绍* bedtools用户范围

Bioconductor版本:发展(3.18)

翻译bedtools命令行调用从Bioconductor * R代码调用函数范围基础设施。这是旨在培养新手Bioconductor用户和比较这两个框架的语法和语义。

作者:迈克尔•劳伦斯

维护人员:迈克尔·劳伦斯< michafla gene.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“HelloRanges”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	注释,报道,DataImport,GenomeAnnotation,SequenceMatching,测序,软件,VariantAnnotation
版本	1.27.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(6.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	方法,BiocGenerics,S4Vectors(> = 0.17.39),IRanges(> = 2.13.12),GenomicRanges(> = 1.31.10),Biostrings(> = 2.41.3),BSgenome,GenomicFeatures(> = 1.31.5),VariantAnnotation(> = 1.19.3),Rsamtools,GenomicAlignments(> = 1.15.7),rtracklayer(> = 1.33.8),GenomeInfoDb,SummarizedExperiment,BiocIO
进口	docopt、统计工具,跑龙套
链接
建议	HelloRangesData,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	OMICsPCA
建议我	plyranges
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包
Windows二进制	HelloRanges_1.27.0.zip
macOS二进制(x86_64)	HelloRanges_1.27.0.tgz
macOS二进制(arm64)	HelloRanges_1.27.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HelloRanges
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ HelloRanges
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/HelloRanges/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/HelloRanges/
包下载报告	下载数据