R453Plus1Toolbox

DOI:10.18129 / B9.bioc.R453Plus1Toolbox

这是发展R453Plus1Toolbox版本;稳定的发布版本,请参阅R453Plus1Toolbox。

一个包的导入从罗氏的基因组定序器系统和分析数据

Bioconductor版本:发展(3.18)

R453Plus1工具箱包含有用的函数生成的数据分析罗氏的454测序平台。它增加了功能质量保证以及注释和可视化的检测基因变异,补充的软件工具运送罗氏公司和他们的产品。此外,管道检测的结构变异。

作者:汉斯Klein Christoph Bartenhagen基督教Ruckert

维护人员:汉斯克莱因< h。克莱恩在uni-muenster.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“R453Plus1Toolbox”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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PDF	R脚本	一个包的导入从罗氏的基因组定序器系统和分析数据
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文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,DataRepresentation,基础设施,质量控制,ReportWriting,测序,软件,可视化
版本	1.51.0
Bioconductor自	BioC 2.7 (r - 2.12)(12.5年)
许可证	LGPL-3
取决于	R(> = 2.12.0)、方法VariantAnnotation(> = 1.25.11),Biostrings(> = 2.47.6),Biobase
进口	跑龙套,grDevices、图形、数据、工具xtable, R2HTML, TeachingDemos,BiocGenerics,S4Vectors(> = 0.17.25),IRanges(> = 2.13.12),XVector,GenomicRanges(> = 1.31.8),SummarizedExperiment,biomaRt,BSgenome(> = 1.47.3),Rsamtools,ShortRead(> = 1.37.1)
链接
建议	rtracklayer,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer2
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	R453Plus1Toolbox_1.51.0.tar.gz
Windows二进制	R453Plus1Toolbox_1.51.0.zip
macOS二进制(x86_64)	R453Plus1Toolbox_1.51.0.tgz
macOS二进制(arm64)	R453Plus1Toolbox_1.51.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/R453Plus1Toolbox
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ R453Plus1Toolbox
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/R453Plus1Toolbox/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/R453Plus1Toolbox/
包下载报告	下载数据