- 家
- Bioconductor 3.2
- 软件包
- CNVPanelizer
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“CNVPanelizer”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
CNVPanelizer
  |
这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CNVPanelizer。
可靠的CNV检测目标排序的应用程序
Bioconductor版本:3.2
这种方法允许使用未匹配正常组织样本的集合。我们的方法使用一个非参数引导二次抽样可用的参考样本估计的分布从目标序列读取计数。受随机森林,这是结合过程次级样本相关的扩增子的每个目标基因。获得的信息使我们能够可靠地基因的拷贝数畸变程度进行分类。
作者:克里斯蒂奥利维拉(aut)托马斯·沃尔夫(aut (cre), Volker Endris[所有],妮可Pfarr[所有],Wilko Weichert(黑色)
维修工:托马斯·沃尔夫< thomas_wolf71 gmx.com >
从内部引用(R,回车引用(“CNVPanelizer”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (“CNVPanelizer”)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“CNVPanelizer”)
| CNVPanelizer | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 分类,CopyNumberVariation,报道,归一化,测序,软件 |
| 版本 | 1.0.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(0.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.2.0),GenomicRanges |
| 进口 | NOISeq,IRanges,Rsamtools,exomeCopy,foreach,ggplot2,plyr,xlsx |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,RUnit,BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | CNVPanelizer_1.0.0.tar.gz |
| Windows二进制 | CNVPanelizer_1.0.0.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | CNVPanelizer_1.0.0.tgz |
| Mac OS X 10.9(小牛) | CNVPanelizer_1.0.0.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/cnvpanelizer/tree/release - 3.2 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/CNVPanelizer/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
