要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("ChAMP")
在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。
该软件包适用于Bioconductor的3.2版本;有关稳定的最新发布版本,请参见冠军.
Bioconductor版本:3.2
该软件包包括质量控制指标、规范化方法的选择和识别差异甲基化区域和突出拷贝数畸变的新方法。此外,还提出了一种利用BS和oxBS样品计算hmC的方法。
作者:蒂芙尼·莫里斯[中文],李·布彻[中文],安德鲁·费伯[中文],安德鲁·特申多夫[中文],安库尔·查克拉瓦蒂[中文]
维护者:Tiffany Morris
引用(来自R,输入引用(“冠军”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("ChAMP")
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“冠军”)
包 | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CopyNumber,MethylationArray,微阵列,归一化,软件,TwoChannel |
版本 | 1.8.2 |
在Bioconductor中 | BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.0.1),minfi,ChAMPdata,Illumina450ProbeVariants.db |
进口 | 股东价值分析,IlluminaHumanMethylation450kmanifest,limma,RPMM,DNAcopy,preprocessCore,嫁祸于,marray,西瓜,plyr,IRanges,GenomicRanges |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
这取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
包的来源 | ChAMP_1.8.2.tar.gz |
Windows二进制 | ChAMP_1.8.2.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | ChAMP_1.8.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | ChAMP_1.8.2.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/ChAMP/tree/release-3.2 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/ChAMP/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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