要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ dss”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.2版;对于稳定的最新版本,请参阅DSS。
生物导体版本:3.2
DSS是一个R库,对基于计数的测序数据进行不同的分析。它从RNA-Seq检测到差异表达的基因(DEG),并从甲基化的基因座或区域(DML/DMR)中检测到亚硫酸盐测序(BS-SEQ)。DSS的核心是一种新的分散收缩方法,用于估算γ-波森或β-二比分布的分散参数。
作者:hao wu
维护者:hao wu
引用(从r内,输入引用(“ DSS”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ dss”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ DSS”)
带分散收缩的RNA-seq数据的差异表达 | ||
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | chipseq,,,,DNAMETHYLATY,,,,差异性,,,,差甲基化,,,,基因表达,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 2.10.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.11(R-2.15)(3。5年) |
执照 | GPL |
要看 | 生物酶,,,,BSSEQ,花键,方法 |
进口 | |
链接 | |
建议 | 生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | dmrcate |
进口我 | |
建议我 | 恰当的 |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | dss_2.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | dss_2.10.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.6(雪豹) | dss_2.10.0.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | dss_2.10.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/dss/tree/release-3.2 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/dss/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |