要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("GEOsearch")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.2版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GEOsearch.
Bioconductor版本:3.2
GEOsearch是NCBI GEO(基因表达综合)的可扩展搜索引擎。GEOsearch不是直接搜索词,而是可以找到搜索词中包含的所有基因名,并在GEO数据库中同时搜索所有基因名的别名。GEOsearch还提供其他功能,例如在搜索结果中总结常见的生物学关键词。
作者:纪志成、纪宏凯
维护人员:Zhicheng Ji
引用(从R中,输入引用(“GEOsearch”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("GEOsearch")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“GEOsearch”)
基因表达综合的可扩展搜索引擎 | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GUI,软件 |
版本 | 1.0.1 |
Bioconductor自 | BioC 3.2 (R-3.2)(0.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 3.2) |
进口 | org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db |
链接 | |
建议 | knitr,闪亮的,DT,org.Ag.eg.db,org.At.tair.db,org.Bt.eg.db,org.Ce.eg.db,org.Cf.eg.db,org.Dm.eg.db,org.Dr.eg.db,org.EcK12.eg.db,org.EcSakai.eg.db,org.Gg.eg.db,org.Mmu.eg.db,org.Pf.plasmo.db,org.Pt.eg.db,org.Rn.eg.db,org.Sc.sgd.db,org.Ss.eg.db,org.Xl.eg.db |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | GEOsearch_1.0.1.tar.gz |
Windows二进制 | GEOsearch_1.0.1.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | GEOsearch_1.0.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛队) | GEOsearch_1.0.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/GEOsearch/tree/release-3.2 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/GEOsearch/ |
包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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