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这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本，请参见GeneNetworkBuilder．

从ChIP-chip/ChIP-seq和Expression数据构建监管网络

Bioconductor版本:3.2

应用ChIP-chip或ChIP-seq，以及microarray或RNA-seq基因表达数据发现转录因子的直接或间接靶点。从ChIP-chip或ChIP-seq中输入一个TF的潜在靶点基因列表和基因表达结果，GeneNetworkBuilder生成该TF的调控网络。

作者:欧建宏，刘海波，Heidi A Tissenbaum, Julie Zhu

维护者:欧建宏<建宏。你在umassmed。edu>

安装

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文档

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browseVignettes(“GeneNetworkBuilder”)

PDF		GeneNetworkBuilder装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GraphAndNetwork，微阵列，测序，软件
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.15.1)，Rcpp(> = 0.9.13),图
进口	plyr，图
链接	Rcpp
建议	RUnit，BiocGenerics，Rgraphviz，XML，RCytoscape，RBGL，knitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	GeneNetworkBuilder_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	GeneNetworkBuilder_1.12.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	GeneNetworkBuilder_1.12.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	GeneNetworkBuilder_1.12.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/GeneNetworkBuilder/tree/release-3.2
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GeneNetworkBuilder/
软件包下载报告	下载数据