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##尝试http://如果不支持https:// URL(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ medips”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.2版;对于稳定的最新版本,请参阅Medips。
生物导体版本:3.2
开发了MEDIP,用于分析源自甲基化DNA免疫沉淀(MEDIP)实验的数据,然后进行测序(MEDIP-SEQ)。但是,MEDIP提供了分析任何定量测序数据(例如chip-seq,mbd-seq,cms-seq等)的功能,包括计算样品组和饱和度和相关分析之间的差异覆盖率。
作者:Lukas Chavez,Matthias Lienhard,Joern Dietrich,Isaac Lopez Moyado
维护者:dkfz.de>的Lukas Chavez
引用(从r内,输入引用(“ MEDIPS”)
):
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Browsevignettes(“ Medips”)
Medips | ||
参考手册 |
生物浏览 | chipseq,,,,库务,,,,覆盖范围,,,,CPGISLAND,,,,DNAMETHYLATY,,,,差异性,,,,遗传学,,,,基因数,,,,微阵列,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,测序,,,,测序,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.20.1 |
在生物导体中 | Bioc 2.7(R-2.12)(5。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 3.0),BSGENOME,,,,rsamtools |
进口 | 基因组机,,,,生物弦,图形,gtools,,,,iranges,方法,统计,utils,EDGER,,,,DNACOPIGY,,,,Biomart,,,,rtracklayer,,,,预处理 |
链接 | |
建议 | bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,Medipsdata,,,,生物使用 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | Medips_1.20.1.tar.gz |
Windows二进制 | Medips_1.20.1.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | Medips_1.20.0.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | Medips_1.20.1.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/medips/tree/release-3.2 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/medips/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |