要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("MSnbase")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.2版本;有关稳定的最新发布版本,请参见MSnbase.
Bioconductor版本:3.2
基于ms的蛋白质组学数据的基本绘图、数据操作和处理。
作者:Laurent Gatto
维护者:Laurent Gatto
引用(从R中,输入引用(“MSnbase”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("MSnbase")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“MSnbase”)
基于ms的蛋白质组学的基本函数和类 | ||
MSnbase发展 | ||
MSnbase IO功能 | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,基础设施,MassSpectrometry,蛋白质组学,质量控制,软件 |
版本 | 1.18.1 |
Bioconductor自 | BioC 2.8 (R-2.13)(5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(>= 3.1),方法,BiocGenerics(> =是0.7.1),Biobase(> = 2.15.2),mzR,BiocParallel,ProtGenerics |
进口 | plyr,IRanges,preprocessCore,vsn、网格reshape2stats4,affy,嫁祸于,pcaMethods,mzID(> = 1.5.2),MALDIquant(> = 1.12),消化,晶格,ggplot2,S4Vectors,Rcpp |
链接 | Rcpp |
建议 | testthat,动物园,knitr(> = 1.1.0版),的方式,Rdisop,pRoloc,pRolocdata(> = 1.7.1上),msdata,roxygen2,rgl,BiocStyle,imputeLCMD,规范,gplots |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/lgatto/MSnbase |
BugReports | https://github.com/lgatto/MSnbase/issues |
取决于我 | DAPAR,msmsEDA,msmsTests,ProCoNA,pRoloc,pRolocdata,pRolocGUI,proteoQC,RforProteomics,synapter |
进口我 | MSnID,MSstats,Pbase,ProteomicsAnnotationHubData |
建议我 | AnnotationHub,biobroom,BiocGenerics,等压线,qcmetrics,rpx |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | MSnbase_1.18.1.tar.gz |
Windows二进制 | MSnbase_1.18.1.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6(雪豹) | MSnbase_1.18.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛队) | MSnbase_1.18.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/MSnbase/tree/release-3.2 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/MSnbase/ |
包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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