要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("MSnbase")

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MSnbase

此包适用于Bioconductor的3.2版本;有关稳定的最新发布版本,请参见MSnbase

基于ms的蛋白质组学的基本函数和类

Bioconductor版本:3.2

基于ms的蛋白质组学数据的基本绘图、数据操作和处理。

作者:Laurent Gatto ,由余光创、Samuel Wieczorek、Vasile-Cosmin Lazar、Vladislav Petyuk、Thomas Naake和Sebastian Gibb贡献。

维护者:Laurent Gatto

引用(从R中,输入引用(“MSnbase”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("MSnbase")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“MSnbase”)

PDF 基于ms的蛋白质组学的基本函数和类
PDF MSnbase发展
PDF MSnbase IO功能
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImport基础设施MassSpectrometry蛋白质组学质量控制软件
版本 1.18.1
Bioconductor自 BioC 2.8 (R-2.13)(5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(>= 3.1),方法,BiocGenerics(> =是0.7.1),Biobase(> = 2.15.2),mzRBiocParallelProtGenerics
进口 plyrIRangespreprocessCorevsn、网格reshape2stats4,affy嫁祸于pcaMethodsmzID(> = 1.5.2),MALDIquant(> = 1.12),消化晶格ggplot2S4VectorsRcpp
链接 Rcpp
建议 testthat动物园knitr(> = 1.1.0版),的方式RdisoppRolocpRolocdata(> = 1.7.1上),msdataroxygen2rglBiocStyleimputeLCMD规范gplots
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/lgatto/MSnbase
BugReports https://github.com/lgatto/MSnbase/issues
取决于我 DAPARmsmsEDAmsmsTestsProCoNApRolocpRolocdatapRolocGUIproteoQCRforProteomicssynapter
进口我 MSnIDMSstatsPbaseProteomicsAnnotationHubData
建议我 AnnotationHubbiobroomBiocGenerics等压线qcmetricsrpx
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 MSnbase_1.18.1.tar.gz
Windows二进制 MSnbase_1.18.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) MSnbase_1.18.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队) MSnbase_1.18.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/MSnbase/tree/release-3.2
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/MSnbase/
包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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弗雷德·哈钦森癌症研究中心