要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“MotIV”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见MotIV.
Bioconductor版本:3.2
这个包使用STAMP将一组图案与给定的数据库(例如JASPAR)进行比较。它也可以用来可视化图案,图案分布,模块和过滤器图案。
作者:Eloi Mercier, Raphael Gottardo
维护者:Eloi Mercier < bcgsc的Mercier。ca>, Raphael Gottardo
引文(从R内,输入引用(“MotIV”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“MotIV”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“MotIV”)
MotIV用户指南 | ||
参考手册 |
biocViews | ChIPSeq,ChIPchip,GenomicSequence,微阵列,MotifAnnotation,软件 |
版本 | 1.26.0 |
在Bioconductor | BioC 2.6 (R-2.11)(6年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 2.10),BiocGenerics(> = 0.1.0) |
进口 | 图形,网格,方法,S4Vectors,IRanges(> = 1.13.5),Biostrings(> = 1.24.0),晶格,rGADEM,跑龙套 |
链接 | |
建议 | rtracklayer |
SystemRequirements | GNU科学图书馆>= 1.6 (http://www.gnu.org/software/gsl/) |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | motifStack |
进口我 | |
建议我 | MotifDb |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | MotIV_1.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | MotIV_1.26.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | MotIV_1.26.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | MotIV_1.26.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/MotIV/tree/release-3.2 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/MotIV/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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