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Sepa

此软件包适用于生物导体的3.2版;对于稳定的最新版本,请参阅Sepa

Sepa

生物导体版本:3.2

给定单细胞RNA-seq数据和细胞或伪时间单元顺序的真实实验时间,SEPA为用户提供了方便的功能,使用户将基因分配为不同的基因表达模式,例如恒定,单调增加和增加,然后减少。然后,SEPA进行富集分析以分析具有相同或相似模式的基因的功能作用。

作者:Zhicheng ji,洪凯吉

维护者:zhicheng ji

引用(从r内,输入引用(“ sepa”)):

安装

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文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ sepa”)

PDF SEPA:单细胞基因表达模式分析
PDF 参考手册

细节

生物浏览 ,,,,GUI,,,,基因表达,,,,软件,,,,可视化
版本 1.0.0
在生物导体中 Bioc 3.2(R-3.2)(0.5岁)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 2.10.0)
进口 GGPLOT2,,,,闪亮的,,,,topgo,,,,分段,,,,RESHAPE2,,,,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db
链接
建议 尼特
系统要求
增强
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取决于我
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 sepa_1.0.0.0.tar.gz
Windows二进制 sepa_1.0.0.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) sepa_1.0.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) sepa_1.0.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/sepa/tree/release-3.2
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/sepa/
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