要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“clonotypeR”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

clonotypeR

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见clonotypeR

T细胞抗原受体序列高通量分析

Bioconductor版本:3.2

T细胞抗原受体序列的高通量分析编码T细胞受体的基因是通过体细胞重组产生的,产生了巨大的V, (D)和J片段的组合。重组过程中的附加过程在V和J段之间产生额外的序列多样性。总的来说,这个高度可变的区域被称为CDR3循环。该软件包的目的是处理和定量分析来自多个序列库的数百万个V-CDR3-J组合,称为克隆型。

作者:Charles Plessy < Plessy at riken.jp>

维护者:Charles Plessy < Plessy at riken.jp>

引文(从R内,输入引用(“clonotypeR”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“clonotypeR”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“clonotypeR”)

超文本标记语言 clonotypeR用户指南
PDF 参考手册
文本 自述
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 测序软件
版本 1.8.0
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年)
许可证 文件许可
取决于
进口 方法
链接
建议 BiocGenerics刨边机knitrpvclustRUnit素食主义者
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports http://clonotyper.branchable.com/Bugs/
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 clonotypeR_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 clonotypeR_1.8.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) clonotypeR_1.8.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) clonotypeR_1.8.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/clonotypeR/tree/release-3.2
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/clonotypeR/
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