要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("ddCt")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

ddCt

此包适用于Bioconductor的3.2版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ddCt

用于定量实时PCR (qRT-PCR)分析的ddCt算法

Bioconductor版本:3.2

Delta-Delta-Ct (ddCt)算法是一种用实时定量PCR (qRT-PCR)实验测定相对基因表达的近似方法。与其他方法相比,该方法不需要每个引物-靶对的标准曲线,因此在保持放大效率的前提下,减少了工作量,却能得到足够准确的结果。ddCt包实现了一个收集、分析和可视化qRT-PCR结果的管道,例如来自TaqMan SDM软件的结果,主要使用ddCt方法。管道既可以通过命令行脚本调用,也可以通过由s4 -类、方法和函数组成的API调用。

作者:张继涛,鲁道夫·比佐克,马库斯·鲁什豪普特

维护者:Jitao David Zhang

引用(从R中,输入引用(ddCt)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("ddCt")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes (ddCt)

PDF 利用ddCt包中的端到端脚本分析RT-PCR数据
PDF 如何应用ddCt方法
PDF 介绍用于qRT-PCR数据分析的ddCt方法:背景、算法和实例
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneExpressionMicrotitrePlateAssay软件qPCR
版本 1.26.0
Bioconductor自 BioC 2.5 (R-2.10)(6.5年)
许可证 LGPL-3
取决于 R(>= 2.3.0),方法
进口 Biobase(> = 1.10.0),RColorBrewer(> = 0.1 3),xtable晶格BiocGenerics
链接
建议 RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 ddCt_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 ddCt_1.26.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) ddCt_1.26.0.tgz
Mac OS X 10.9(小牛队) ddCt_1.26.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/ddCt/tree/release-3.2
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/ddCt/
包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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支持»

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弗雷德·哈钦森癌症研究中心