要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("ddCt")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.2版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ddCt.
Bioconductor版本:3.2
Delta-Delta-Ct (ddCt)算法是一种用实时定量PCR (qRT-PCR)实验测定相对基因表达的近似方法。与其他方法相比,该方法不需要每个引物-靶对的标准曲线,因此在保持放大效率的前提下,减少了工作量,却能得到足够准确的结果。ddCt包实现了一个收集、分析和可视化qRT-PCR结果的管道,例如来自TaqMan SDM软件的结果,主要使用ddCt方法。管道既可以通过命令行脚本调用,也可以通过由s4 -类、方法和函数组成的API调用。
作者:张继涛,鲁道夫·比佐克,马库斯·鲁什豪普特
维护者:Jitao David Zhang
引用(从R中,输入引用(ddCt)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("ddCt")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes (ddCt)
利用ddCt包中的端到端脚本分析RT-PCR数据 | ||
如何应用ddCt方法 | ||
介绍用于qRT-PCR数据分析的ddCt方法:背景、算法和实例 | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,MicrotitrePlateAssay,软件,qPCR |
版本 | 1.26.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.5 (R-2.10)(6.5年) |
许可证 | LGPL-3 |
取决于 | R(>= 2.3.0),方法 |
进口 | Biobase(> = 1.10.0),RColorBrewer(> = 0.1 3),xtable,晶格,BiocGenerics |
链接 | |
建议 | RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | ddCt_1.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | ddCt_1.26.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | ddCt_1.26.0.tgz |
Mac OS X 10.9(小牛队) | ddCt_1.26.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/ddCt/tree/release-3.2 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/ddCt/ |
包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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