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这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本，请参见facopy．

基于特征的关联和基因集富集用于癌症拷贝数改变分析

Bioconductor版本:3.2

facopy是一个R包微调癌症CNA关联建模。关联直接测量感兴趣的基因组特征，在基因的情况下，由于数据的新颖内部处理，可以执行下游基因集富集分析。该软件开辟了一种方法来系统地检查肿瘤表型中CNA分布的差异，例如那些与肿瘤类型、位置和进展有关的差异。目前，支持11种不同方法的输出格式，这些方法分析来自全基因组/外显子组测序和SNP微阵列的数据。还支持多基因组、变异类型和变量类型。

作者:David Mosen-Ansorena

维护者:David Mosen-Ansorena

安装

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文档

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PDF		facopy
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariation，GeneSetEnrichment，遗传学，GenomicVariation，微阵列，测序，软件，可视化
版本	1.4.1
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(1.5年)
许可证	Cc by-nc 4.0
取决于	R(>= 3.0)，方法，cgdsr(> = 1.1.30),硬币(> = 1.0),ggplot2，gridExtra，facopy.annot、网格
进口	注释，data.table，剂量，FactoMineR，GO.db，GOstats，石墨，igraph，IRanges，质量，nnet，reshape2，Rgraphviz，尺度
链接
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	facopy_1.4.1.tar.gz
Windows二进制	facopy_1.4.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	facopy_1.4.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks)	facopy_1.4.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/facopy/tree/release-3.2
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/facopy/
软件包下载报告	下载数据