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安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (msa)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
msa
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这个包是3.2版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅msa。
多序列比对
Bioconductor版本:3.2
这个包提供了一个统一的R / Bioconductor接口多序列比对算法ClustalW ClustalOmega和肌肉。所有三个算法集成在包,因此,他们不依赖于任何外部软件工具,可用于所有主要平台。多重序列比对算法辅以精细打印多个函数使用乳胶包TeXshade序列比对。
作者:恩里科Bonatesta Christoph Horejs-Kainrath,乌尔里希Bodenhofer
维护人员:乌尔里希Bodenhofer < Bodenhofer在bioinf.jku.at >
从内部引用(R,回车引用(msa)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”) biocLite (msa)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (msa)
| msa - R包多重序列比对 | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 对齐,MultipleComparison,MultipleSequenceAlignment,测序,软件 |
| 版本 | 1.2.1 " |
| Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(1年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R(> = 3.1.0)、方法Biostrings(> = 2.30.0) |
| 进口 | Rcpp(> = 0.11.1),BiocGenerics,IRanges(> = 1.20.0),S4Vectors、工具 |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | Biobase,knitr |
| SystemRequirements | GNU使 |
| 增强了 | |
| URL | http://www.bioinf.jku.at/software/msa/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | msa_1.2.1.tar.gz |
| Windows二进制 | msa_1.2.1.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | msa_1.2.0.tgz |
| Mac OS X 10.9(小牛) | msa_1.2.1.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/msa/tree/release - 3.2 |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/msa/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
