要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“qrqc”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

qrqc

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见qrqc

快速阅读质量控制

Bioconductor版本:3.2

快速扫描读取并收集基本频率和质量频率、读取长度、位置k-mers和频繁序列的统计信息。生成用于质量控制管道的统计数据的图形输出,以及可选的HTML质量报告。S4 sequencsummarmary对象允许围绕收集到的数据编写特定的测试和功能。

作者:文斯·布法罗

维护者:Vince Buffalo

引文(从R内,输入引用(“qrqc”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“qrqc”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“qrqc”)

PDF 使用qrqc包收集关于序列质量的信息
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImport预处理质量控制测序软件可视化
版本 1.24.0
在Bioconductor BioC 2.8 (R-2.13)(5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 重塑ggplot2BiostringsbiovizBase酿造xtableRsamtools(> = 1.19.38),testthat
进口 重塑ggplot2BiostringsbiovizBase、图形、方法、plyr,统计数据
链接 Rsamtools
建议
SystemRequirements
增强了
URL http://github.com/vsbuffalo/qrqc
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 qrqc_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 qrqc_1.24.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) qrqc_1.24.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) qrqc_1.24.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/qrqc/tree/release-3.2
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/qrqc/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

弗雷德哈钦森癌症研究中心