要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“qrqc”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见qrqc.
Bioconductor版本:3.2
快速扫描读取并收集基本频率和质量频率、读取长度、位置k-mers和频繁序列的统计信息。生成用于质量控制管道的统计数据的图形输出,以及可选的HTML质量报告。S4 sequencsummarmary对象允许围绕收集到的数据编写特定的测试和功能。
作者:文斯·布法罗
维护者:Vince Buffalo
引文(从R内,输入引用(“qrqc”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“qrqc”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“qrqc”)
使用qrqc包收集关于序列质量的信息 | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,预处理,质量控制,测序,软件,可视化 |
版本 | 1.24.0 |
在Bioconductor | BioC 2.8 (R-2.13)(5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | 重塑,ggplot2,Biostrings,biovizBase,酿造,xtable,Rsamtools(> = 1.19.38),testthat |
进口 | 重塑,ggplot2,Biostrings,biovizBase、图形、方法、plyr,统计数据 |
链接 | Rsamtools |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://github.com/vsbuffalo/qrqc |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | qrqc_1.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | qrqc_1.24.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | qrqc_1.24.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | qrqc_1.24.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/qrqc/tree/release-3.2 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/qrqc/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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