要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("snpStats")

在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。

snpStats

该软件包适用于Bioconductor的3.2版本;有关稳定的最新发布版本,请参见snpStats

SnpMatrix和XSnpMatrix类和方法

Bioconductor版本:3.2

大型SNP关联研究的分类和统计方法。这扩展了早期的snpMatrix包,允许基因型的不确定性。

作者:David Clayton

维护者:David Clayton

引用(来自R,输入引用(“snpStats”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("snpStats")

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“snpStats”)

PDF 数据输入
PDF
PDF 归因和荟萃分析
PDF LD统计
PDF 主成分分析
PDF snpMatrix-differences
PDF snpStats介绍
PDF TDT)测试
PDF 参考手册

细节

biocViews GeneticVariability微阵列单核苷酸多态性软件
版本 1.20.0
在Bioconductor中 BioC 2.8 (R-2.13)(5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 2.10.0),生存矩阵、方法
进口 图形,grDevices,统计,utils,BiocGenericszlibbioc
链接
建议 hexbin
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我 GGBaseGGdataggtut
进口我 FunciSNPGGtoolsgQTLstatsgwascatldblock
建议我 crlmmGWASToolsVariantAnnotation
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

包的来源 snpStats_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 snpStats_1.20.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) snpStats_1.20.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) snpStats_1.20.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/snpStats/tree/release-3.2
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/snpStats/
软件包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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请阅读发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一:

Fred Hutchinson癌症研究中心