要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ tigre”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

蒂格

此软件包适用于生物导体的3.2版;对于稳定的最新版本,请参阅蒂格

通过高斯过程重建表达的转录因子推断

生物导体版本:3.2

Tigre软件包实现了我们的高斯过程微分方程模型的方法,用于分析单个输入基序网络的基因表达时间序列。该软件包可用于从已知靶基因的表达测量中推断出未观察到的转录因子(TF)蛋白浓度,或对TF的候选靶标进行排名。

作者:Antti Honkela,Pei Gao,Jonatan Ropponen,Miika-Petteri Matikainen,Magnus Rattray,Neil D. Lawrence

维护者:athti honkela

引用(从r内,输入引用(“ Tigre”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ tigre”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Tigre”)

PDF Tigre快速指南
PDF Tigre用户指南
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 贝叶斯,,,,基因表达,,,,结肠管制,,,,微阵列,,,,网络引导,,,,软件,,,,时间科,,,,转录
版本 1.24.2
在生物导体中 Bioc 2.6(R-2.11)(6年)
执照 AGPL-3
要看 r(> = 2.11.0),生物基因,,,,生物酶
进口 方法,AnnotationDbi,,,,GPLOTS,图形,统计,utils,注释,,,,DBI,,,,rsqlite
链接
建议 drosgenome1.db,,,,彪马,,,,Lumi,,,,生物使用
系统要求
增强
URL https://github.com/ahonkela/tigre
BugReports https://github.com/ahonkela/tigre/issues
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 tigre_1.24.2.tar.gz
Windows二进制 tigre_1.24.2.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) tigre_1.24.0.tgz
Mac OS X 10.9(Mavericks) tigre_1.24.2.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/tigre/tree/release-3.2
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/tigre/
软件包下载报告 下载统计

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生物导体

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支持»

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户
弗雷德·哈钦森癌症研究中心