要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14

这个包适用于Bioconductor 3.2版;有关稳定的最新发布版本,请参见RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14

RNAseq实验:通过高通量测序HNRNPC敲低和对照HeLa细胞的转录分析

Bioconductor版本:3.2

该包包含8个BAM文件,每运行一个测序文件。每个BAM文件通过以下步骤获得:(1)用TopHat2将reads(配对端)对准hg19完整基因组,然后(2)将子集设置为只对chr14进行对准。有关实验的详细信息,请参阅ArrayExpress数据库中的登录号E-MTAB-1147,包括已发表的研究(扎纳克等人,2012年)和FASTQ文件的链接。

作者:H. Pages

维护:H. Pages

引文(从R内,输入引用(“RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14”)

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews ArrayExpressExperimentData地理基因组Homo_sapiens_DataNCIRNASeqDataSequencingData
版本 0.8.0
许可证 LGPL
取决于
进口
链接
建议 GenomicAlignmentsBiocInstaller
SystemRequirements
增强了
URL http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MTAB-1147/
全靠我
进口我
建议我 BiocParallelGenomicAlignmentsGenomicFiles咆哮RsamtoolsSplicingGraphs
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14_0.8.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14/
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