要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocliite ("AneuFinder")
在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。
这个包是3.4版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见AneuFinder。
Bioconductor版本:3.4
该软件包实现了CNV调用,绘图,导出和分析全基因组单细胞测序数据的功能。
作者:Aaron Taudt, Bjorn Bakker, David Porubsky
维护者:Aaron Taudt < Aaron。Taudt at gmail.com>
引用(来自R,输入引用(“AneuFinder”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocliite ("AneuFinder")
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“AneuFinder”)
R脚本 | 快速介绍AneuFinder | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CopyNumberVariation,GenomicVariation,HiddenMarkovModel,软件,WholeGenome |
版本 | 1.2.1 " |
在Bioconductor中 | BioC 3.3 (R-3.3)(1年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.3),GenomicRanges,cowplot,AneuFinderData |
进口 | 方法,utils, grDevices,图形,统计,foreach,doParallel,BiocGenerics,S4Vectors,GenomeInfoDb,IRanges,Rsamtools,bamsignals,DNAcopy,Biostrings,GenomicAlignments,ggplot2,reshape2,ggdendro,ggrepel,ReorderCluster,mclust |
链接 | |
建议 | knitr,BiocStyle,testthat,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/ataudt/aneufinder.git |
这取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
包的来源 | AneuFinder_1.2.1.tar.gz |
Windows二进制 | AneuFinder_1.2.1.zip(32- & 64位) |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | AneuFinder_1.2.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/AneuFinder/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/AneuFinder/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
请阅读发布指南。将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一: