要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“COMPASS”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见指南针.
Bioconductor版本:3.4
COMPASS是一个统计框架,能够对抗原特异性t细胞亚群进行无偏倚分析。COMPASS使用贝叶斯分层框架来建模所有观察到的细胞子集,并选择最有可能是抗原特异性的,同时正则化多参数空间中经常出现的小细胞计数。该模型为每个细胞亚群和每个样本提供了特异性的后验概率,可用于分析受试者对感染或疫苗接种等外部刺激的免疫反应。
作者:林恩,凯文·乌西,格雷格·菲纳克,拉维奥·科尔德(pheatmap)
维护者:Greg Finak
引文(从R内,输入引用(“指南针”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“COMPASS”)
超文本标记语言 | R脚本 | 指南针 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | FlowCytometry,软件 |
版本 | 1.12.0 |
在Bioconductor | BioC 2.14 (R-3.1)(3年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.0.2) |
进口 | Rcpp,data.table,RColorBrewer,尺度、网格plyr,knitr,abind,线索, grDevices, utils,pdist |
链接 | Rcpp(> = 0.11.0)它 |
建议 | flowWorkspace(> = 3.9.66),flowCore,ncdfFlow,闪亮的,testthat,devtools,Kmisc,flowWorkspaceData |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/RGLab/COMPASS/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | COMPASS_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | COMPASS_1.12.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | COMPASS_1.12.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/COMPASS/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/COMPASS/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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