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deseq2
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此软件包适用于生物导体的3.4版；对于稳定的最新版本，请参阅deseq2。
基于负二项式分布的差异基因表达分析
生物导体版本：3.4
估计来自高通量测序测定法的计数数据的依赖性依赖性，并基于模型使用负二项式分布测试差异表达。
作者：迈克尔·洛夫，西蒙·安德斯，沃尔夫冈·胡伯
维护者：迈克尔·洛夫（Michael Love）
引用（从r内，输入引用（“ deseq2”））：
安装
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文档
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browsevignettes（“ deseq2”）
| R脚本 | 用“ DESEQ2”软件包分析RNA-Seq数据 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | chipseq，，，，差异性，，，，基因表达，，，，rnaseq，，，，智者，，，，测序，，，，软件，，，，转录 |
| 版本 | 1.14.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.12（R-3.0）（4年） |
| 执照 | LGPL（> = 3） |
| 要看 | S4VECTORS（> = 0.9.25），iranges，，，，基因组机，，，，总结性特征（> = 1.1.6） |
| 进口 | 生物基因（> = 0.7.5），生物酶，，，，生物比较，，，，GeneFilter， 方法，Locfit，，，，Geneplotter，，，，GGPLOT2，，，，HMISC，，，，RCPP（> = 0.11.0） |
| 链接 | RCPP，，，，rcpparmadillo |
| 建议 | 测试，，，，尼特，，，，生物使用，，，，VSN，，，，pheatmap，，，，rcolorbrewer，，，，呼吸道，，，，ihw，，，，tximport，，，，tximportdata，，，，readr，，，，帕西拉（> = 0.2.10） |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | 阿斯普利，，，，dchiprep，，，，dexseq，，，，Fourcseq，，，，mlseq，，，，RGSEPD，，，，TCC，，，，XBSEQ |
| 进口我 | 阿纳米尔，，，，碎片器，，，，变形，，，，Desubs，，，，差异，，，，EEGC，，，，富集兄弟，，，，Fourcseq，，，，Genogam，，，，glimma，，，，htsfilter，，，，ihwpaper，，，，Isomirs，，，，接口，，，，PCAEXPLORER，，，，地区报告，，，，报告工具，，，，Snphood，，，，Systempiper，，，，topaseq |
| 建议我 | 生物室，，，，生物基因，，，，compcoder，，，，DegReport，，，，德芬德，，，，diffloop，，，，量规，，，，基因组签名，，，，基因组机，，，，ihw，，，，JCTSEQDATA，，，，Onechannelgui，，，，门索，，，，叙事，，，，Ruvseq，，，，斯克兰，，，，single.mtec.transcriptomes，，，，subseq，，，，tximport，，，，方差分区 |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | deseq2_1.14.1.tar.gz |
| Windows二进制 | deseq2_1.14.1.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.9（Mavericks） | deseq2_1.14.1.tgz |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/deseq2/tree/release-3.4 |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/deseq2/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
