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创世纪
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此软件包适用于生物导体的3.4版；对于稳定的最新版本，请参阅创世纪。
结构化样品的遗传估计和推断（Genesis）：分析来自种群结构和/或相关性样本的遗传数据的统计方法
生物导体版本：3.4
Genesis软件包提供了用于在遗传分析中估计，推断和计算种群和谱系结构的方法。当前的实现提供了执行PC-AIR（Conomos等，2015，Gen Epi）和PC链接（Conomos等，2016，AJHG）的功能。PC-Air对全基因组SNP数据进行了主要成分分析，以检测可能包含已知或隐性相关性的样品中的种群结构。与标准PCA不同，PC-Air解释了样本中的相关性，以提供准确的祖先推断，而这些推论不会被家庭结构混淆。PC-Realate使用祖先代表性的主要成分来调整种群结构/祖先，并准确估计最近的遗传相关性，例如亲属系数，IBD共享概率和近交系数。此外，还提供了对定量和二进制表型的有效方差组件估计和混合模型关联测试的功能。
作者：Matthew P. Conomos和Timothy Thornton
维护者：Matthew P. Conomos
引用（从r内，输入引用（“创世纪”））：
安装
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文档
| html | R脚本 | 使用Genesis软件包进行遗传关联测试 |
| html | R脚本 | 使用Genesis软件包的种群结构和相关性推断 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 生物浏览，，，，维度，，，，遗传因素，，，，遗传学，，，，Genomewideassociation，，，，委托人，，，，QualityControl，，，，SNP，，，，软件，，，，统计信息 |
| 版本 | 2.4.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.1（R-3.2）（2年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | |
| 进口 | Gwastools，，，，Seqarray，，，，Seqvartools，，，，生物酶，，，，GDSFMT，，，，图形，grdevices，图形，统计，utils |
| 链接 | |
| 建议 | Snprelate，，，，logistf，，，，民意调查，，，，组合，，，，运行，，，，生物基因，，，，尼特 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | genesis_2.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | genesis_2.4.0.zip |
| Mac OS X 10.9（Mavericks） | GENES_2.4.0.TGZ |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/genesis/tree/release-3.4 |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/genesis/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
