要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("GOstats")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

GOstats

此包适用于Bioconductor的3.4版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GOstats

操作GO和微阵列的工具。

Bioconductor版本:3.4

一套与GO和微阵列数据交互的工具。各种基本的图形操作工具,假设检验和其他简单的计算。

作者:R. Gentleman和S. Falcon

维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者

引用(从R中,输入引用(“GOstats”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("GOstats")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“GOstats”)

PDF R脚本 对不常见的模型生物的超几何测试
PDF R脚本 使用GOstats进行超几何测试
PDF R脚本 使用GOstats可视化数据
PDF 参考手册

细节

biocViews 注释GeneExpressionGeneSetEnrichmentGraphAndNetwork微阵列MultipleComparison通路软件
版本 2.40.0
在Bioconductor公司 BioC 1.6 (R-2.1)或更早的版本(> 12年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.10),Biobase(> = 1.15.29),类别(> = 2.3.26),
进口 Methods, stats, stats4,AnnotationDbi(> = 0.0.89),Biobase(> = 1.15.29),类别(> = 2.3.26),GO.db(> = 1.13.0),RBGL注释(> = 1.13.2),(> = 1.15.15),AnnotationForge
链接
建议 hgu95av2.db(> = 1.13.0),所有GO.db(> = 1.13.0),注释genefilterRColorBrewerRgraphvizxtableSparseMGSEABasegeneplotterorg.Hs.eg.dbRUnitBiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 MineICARDAVIDWebService
进口我 affycoretools吸引categoryComparefacopymvGSTpcaExplorerProCoNAReportingToolssystemPipeR
建议我 BiocCaseStudies类别eisafastLiquidAssociationGSEAlmHTSanalyzeRinteractiveDisplayMineICAmiRLAB中长期规划MmPalateMiRNAoneChannelGUIphenoDistqpgraphRnBeads安全
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 GOstats_2.40.0.tar.gz
Windows二进制 GOstats_2.40.0.zip
Mac OS X 10.9(小牛队) GOstats_2.40.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/GOstats/tree/release-3.4
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/GOstats/
软件包下载报告 下载数据

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支持»

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