要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“基因组”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.4版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GenomeGraphs.
Bioconductor版本:3.4
基因组数据分析需要已知基因组信息和新的实验数据的集成可视化。GenomeGraphs使用bioart包对ensemble执行实时注释查询,并将其转换为网格图形包视图中的基因/转录本结构。这将导致基因组信息与你的数据绘制在一起。GenomeGraphs的另一个优点是可以将不同的数据类型,如阵列CGH、基因表达、测序和其他数据绘制在一个图中,使用相同的基因组坐标系。
作者:Steffen Durinck
维护:Steffen Durinck
引用(从R中,输入引用(“GenomeGraphs”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“基因组”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“GenomeGraphs”)
R脚本 | 基因组用户指南 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 微阵列,软件,可视化 |
版本 | 1.34.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.2 (R-2.7)(9年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(>= 2.10),方法,biomaRt、网格 |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | Genominator,waveTiling |
进口我 | |
建议我 | leeBamViews,益生元,益生元,oneChannelGUI,rMAT,三层 |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | GenomeGraphs_1.34.0.tar.gz |
Windows二进制 | GenomeGraphs_1.34.0.zip |
Mac OS X 10.9(小牛队) | GenomeGraphs_1.34.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/GenomeGraphs/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/GenomeGraphs/ |
包下载报告 | 下载数据 |
支持»
请阅读发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一: