要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“基因组”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

GenomeGraphs

此包适用于Bioconductor的3.4版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GenomeGraphs

绘制来自ensemble的基因组信息

Bioconductor版本:3.4

基因组数据分析需要已知基因组信息和新的实验数据的集成可视化。GenomeGraphs使用bioart包对ensemble执行实时注释查询,并将其转换为网格图形包视图中的基因/转录本结构。这将导致基因组信息与你的数据绘制在一起。GenomeGraphs的另一个优点是可以将不同的数据类型,如阵列CGH、基因表达、测序和其他数据绘制在一个图中,使用相同的基因组坐标系。

作者:Steffen Durinck , James Bullard < Bullard at berkeley.edu>

维护:Steffen Durinck

引用(从R中,输入引用(“GenomeGraphs”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“基因组”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“GenomeGraphs”)

PDF R脚本 基因组用户指南
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 微阵列软件可视化
版本 1.34.0
Bioconductor自 BioC 2.2 (R-2.7)(9年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(>= 2.10),方法,biomaRt、网格
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 GenominatorwaveTiling
进口我
建议我 leeBamViews益生元益生元oneChannelGUIrMAT三层
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 GenomeGraphs_1.34.0.tar.gz
Windows二进制 GenomeGraphs_1.34.0.zip
Mac OS X 10.9(小牛队) GenomeGraphs_1.34.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/GenomeGraphs/tree/release-3.4
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/GenomeGraphs/
包下载报告 下载数据

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