要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ GenomicFiles”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅Genomicfiles。
生物导体版本:3.4
该软件包为“按文件”或“按范围”分发的并行计算提供了基础架构。用户定义的映射器和还原功能为数据组合和操作提供了更多的灵活性。
作者:生物处理程序软件包维护者[AUT,CRE],Valerie Obenchain [AUT],Michael Love [AUT],Lori Shepherd [aut],Martin Morgan [AUT]
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“ GenomicFiles”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ GenomicFiles”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ GenomicFiles”)
R脚本 | 介绍基因组菲尔斯 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
视频 | 从BAM文件读取 - 第2部分 |
生物浏览 | 覆盖范围,,,,DataImport,,,,遗传学,,,,基础设施,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.10.3 |
在生物导体中 | Bioc 2.14(R-3.1)(3年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.1.0),方法,生物基因(> = 0.11.2),基因组机(> = 1.23.21),总结性特征,,,,生物比较(> = 1.1.0),rsamtools(> = 1.17.29),rtracklayer(> = 1.25.3) |
进口 | 基因组签名(> = 1.7.7),iranges,,,,S4VECTORS(> = 0.9.25),变体,,,,GenomeInfodB |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,运行,,,,GeneFilter,,,,Deepsnv,,,,rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14,,,,生物弦,,,,同性恋 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | contibait,,,,德芬德,,,,Erma,,,,GQTLBASE,,,,gqtlstats,,,,准,,,,RQC |
建议我 | 多亚sayExexperiment |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | genomicfiles_1.10.3.tar.gz |
Windows二进制 | genomicfiles_1.10.3.zip |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | genomicfiles_1.10.3.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/genomicfiles/tree/release-3.4 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/genomicfiles/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |