要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源头(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ GenomicInteracions”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

基因组间

此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅基因组间

R用于处理基因组相互作用数据的软件包

生物导体版本:3.4

用于处理基因组相互作用数据的R软件包,例如CHIA-PET / HI-C,带有相互作用信息的基因组特征并产生各种图 /统计数据。

作者:Harmston,N.,Ing-Simmons,E.,Perry,M.,Baresic,A.,Lenhard,B。

维护者:Malcolm Perry ,liz ing-simmons

引用(从r内,输入引用(“基因组互相”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源头(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ GenomicInteracions”)

文档

html R脚本 chiapet_vignette.html
html R脚本 基因组互感
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DataImport,,,,datarepresentation,,,,,,,,基础设施,,,,软件
版本 1.8.1
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(2。5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.3),互动集
进口 rsamtools,,,,rtracklayer,,,,基因组机,,,,iranges,,,,生物基因(> = 0.15.3),Data.Table,,,,Stringr,,,,GenomeInfodB,,,,GGPLOT2, 网格,栅格, 方法,Igraph,,,,S4VECTORS,,,,dplyr,,,,GVIZ,,,,生物酶,图形,统计,utils
链接
建议 尼特,,,,生物使用,,,,测试
系统要求
增强
URL https://github.com/computationalRegulationgenomicsicl/genomicInteractions/
取决于我
进口我
建议我 芝加哥
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 GenomicInteractions_1.8.1.tar.gz
Windows二进制 GenomicInteractions_1.8.1.zip
Mac OS X 10.9(Mavericks) GenomicInteractions_1.8.1.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/genomicinteractions/tree/release-3.4
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/genomicinteractions/
软件包下载报告 下载统计

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户