要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源头(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ GenomicInteracions”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅基因组间。
生物导体版本:3.4
用于处理基因组相互作用数据的R软件包,例如CHIA-PET / HI-C,带有相互作用信息的基因组特征并产生各种图 /统计数据。
作者:Harmston,N.,Ing-Simmons,E.,Perry,M.,Baresic,A.,Lenhard,B。
维护者:Malcolm Perry
引用(从r内,输入引用(“基因组互相”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源头(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ GenomicInteracions”)
html | R脚本 | chiapet_vignette.html |
html | R脚本 | 基因组互感 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | DataImport,,,,datarepresentation,,,,嗝,,,,基础设施,,,,软件 |
版本 | 1.8.1 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(2。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.3),互动集 |
进口 | rsamtools,,,,rtracklayer,,,,基因组机,,,,iranges,,,,生物基因(> = 0.15.3),Data.Table,,,,Stringr,,,,GenomeInfodB,,,,GGPLOT2, 网格,栅格, 方法,Igraph,,,,S4VECTORS,,,,dplyr,,,,GVIZ,,,,生物酶,图形,统计,utils |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,生物使用,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/computationalRegulationgenomicsicl/genomicInteractions/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | 芝加哥 |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | GenomicInteractions_1.8.1.tar.gz |
Windows二进制 | GenomicInteractions_1.8.1.zip |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | GenomicInteractions_1.8.1.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/genomicinteractions/tree/release-3.4 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/genomicinteractions/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |