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此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅Globalancova。
生物导体版本:3.4
我们给出以下论点以支持Globalancova方法:经过适当的归一化,基因表达数据似乎相当对称,离群值并不是真正的问题,因此最小二乘应该相当强大。具有相互作用的ANCOVA产生饱和的数据建模,例如每个组和基因不同。协变量调整可以帮助纠正可能的选择偏差。差异同质性和不相关的残差无法预期。普通最小二乘的应用可无偏见,但不再是最佳估计(高斯 - 马科夫 - 艾特肯)。因此,由于相关性,使用经典的F检验是不合适的。然而,测试统计量反映了与零假设的偏差。结合置换方法,可以估算经验意义水平。或者,近似产生渐近P值。 This work was supported by the NGFN grant 01 GR 0459, BMBF, Germany.
作者:U.Mansmann,R。Meister,M。Hummel,R。Scheufele,S。Knueppel的贡献
维护者:Manuela Hummel
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):
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Browsevignettes(“ Globalancova”)
R脚本 | Globalancova.pdf | |
R脚本 | globalancovadecomp.pdf | |
参考手册 |
生物浏览 | 差异性,,,,微阵列,,,,Onechannel,,,,途径,,,,软件 |
版本 | 3.42.0 |
在生物导体中 | Bioc 1.7(R-2.2)(11。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | 方法,公司,,,,全球测试 |
进口 | 注释,,,,AnnotationDbi |
链接 | |
建议 | 生物酶,,,,注释,,,,go.db,,,,kegg.db,,,,golubeset,,,,Hu6800.db,,,,VSN,,,,gseabase,,,,rgraphviz |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | globalancova_3.42.0.tar.gz |
Windows二进制 | globalancova_3.42.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | globalancova_3.42.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/globalancova/tree/release-3.4 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/globalancova/ |
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