要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("InPAS")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

InPAS

此包适用于Bioconductor的3.4版本;有关稳定的最新发布版本,请参见InPAS

新型多聚腺苷酸化位点(PAS)的鉴定

Bioconductor版本:3.4

选择性多聚腺苷酸化(APA)是发生在大多数人类基因中的重要转录后调控机制之一。InPAS有助于从RNAseq数据中发现新的APA位点。它利用cleanUpdTSeq对识别的APA位点进行微调。

作者:欧建宏,朴成美,Michael R. Green, Julie Zhu

维护者:Jianhong Ou < Jianhong。你在umassmed.edu>

引用(从R中,输入引用(“InPAS”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("InPAS")

文档

超文本标记语言 R脚本 InPAS装饰图案
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews AlternativeSplicing报道DifferentialSplicingGeneRegulationRNASeq测序软件转录
版本 1.6.0
在Bioconductor公司 BioC 3.1 (R-3.2)(2年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R(>= 3.1),方法,BiobaseGenomicRangesGenomicFeaturesS4Vectors
进口 AnnotationDbiBSgenomecleanUpdTSeqGvizseqinrpreprocessCoreIRangesGenomeInfoDbdepmixS4limmaBiocParallel
链接
建议 RUnitBiocGenericsBiocStyleBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10org.Hs.eg.dborg.Mm.eg.dbTxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGeneTxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGenertracklayerknitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 InPAS_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 InPAS_1.6.0.zip
Mac OS X 10.9(小牛队) InPAS_1.6.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/InPAS/tree/release-3.4
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/InPAS/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一: