要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("NanoStringQCPro")
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.4版本;有关稳定的最新发布版本,请参见NanoStringQCPro.
Bioconductor版本:3.4
NanoStringQCPro提供了一组质量指标,可用于评估NanoString mRNA基因表达数据的质量,即识别离群值探针和离群值样本。它还为该数据提供了不同的背景减法和归一化方法。它输出标记样本/探测的建议和一个易于共享的html质量控制输出。
作者:多萝西·尼克尔斯<尼克尔斯。多萝西在gene.com>,托马斯·桑德曼<桑德曼。来自gene.com>的托马斯,罗伯特·齐曼<齐曼。罗伯特在gene.com >,Richard Bourgon
维护者:Robert Ziman < Ziman。罗伯特在gene.com >
引用(从R中,输入引用(“NanoStringQCPro”)
):
要安装这个包,开始R,然后输入:
##尝试http://if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("NanoStringQCPro")
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“NanoStringQCPro”)
R脚本 | NanoStringQCPro概述 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 微阵列,归一化,预处理,质量控制,ReportWriting,软件,mRNAMicroarray |
版本 | 1.6.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.1 (R-3.2)(2年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(>= 3.2),方法 |
进口 | AnnotationDbi(> = 1.26.0),org.Hs.eg.db(> = 2.14.0),Biobase(> = 2.24.0),knitr(> = 1.12),NMF(> = 0.20.5),RColorBrewer(> = 1.0 5),png(> = 0.1 7) |
链接 | |
建议 | roxygen2(> = 4.0.1),testthat,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | NanoStringQCPro_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | NanoStringQCPro_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.9(小牛队) | NanoStringQCPro_1.6.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/NanoStringQCPro/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/NanoStringQCPro/ |
包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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