要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("NanoStringQCPro")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

NanoStringQCPro

此包适用于Bioconductor的3.4版本;有关稳定的最新发布版本,请参见NanoStringQCPro

NanoString mRNA基因表达数据的质量度量和数据处理方法

Bioconductor版本:3.4

NanoStringQCPro提供了一组质量指标,可用于评估NanoString mRNA基因表达数据的质量,即识别离群值探针和离群值样本。它还为该数据提供了不同的背景减法和归一化方法。它输出标记样本/探测的建议和一个易于共享的html质量控制输出。

作者:多萝西·尼克尔斯<尼克尔斯。多萝西在gene.com>,托马斯·桑德曼<桑德曼。来自gene.com>的托马斯,罗伯特·齐曼<齐曼。罗伯特在gene.com >,Richard Bourgon

维护者:Robert Ziman < Ziman。罗伯特在gene.com >

引用(从R中,输入引用(“NanoStringQCPro”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://if https:// url不支持source("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("NanoStringQCPro")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“NanoStringQCPro”)

PDF R脚本 NanoStringQCPro概述
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 微阵列归一化预处理质量控制ReportWriting软件mRNAMicroarray
版本 1.6.0
Bioconductor自 BioC 3.1 (R-3.2)(2年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(>= 3.2),方法
进口 AnnotationDbi(> = 1.26.0),org.Hs.eg.db(> = 2.14.0),Biobase(> = 2.24.0),knitr(> = 1.12),NMF(> = 0.20.5),RColorBrewer(> = 1.0 5),png(> = 0.1 7)
链接
建议 roxygen2(> = 4.0.1),testthatBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 NanoStringQCPro_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 NanoStringQCPro_1.6.0.zip
Mac OS X 10.9(小牛队) NanoStringQCPro_1.6.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/NanoStringQCPro/tree/release-3.4
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/NanoStringQCPro/
包下载报告 下载数据

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