要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“PGSEA”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

PGSEA

此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见PGSEA

参数基因集富集分析

Bioconductor版本:3.4

基因集富集的参数分析

作者:Kyle Furge < Kyle。furge在vai.org>和Karl Dykema < Karl。Dykema在vai.org>

维护者:Karl Dykema < Karl。Dykema在vai.org>

引文(从R内,输入引用(“PGSEA”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“PGSEA”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“PGSEA”)

PDF R脚本 HOWTO: PGSEA
PDF R脚本 PGSEA示例工作流
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列软件
版本 1.48.0
在Bioconductor BioC 2.0 (R-2.5)(10年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 2.10),GO.dbKEGG.dbAnnotationDbiannaffy、方法、Biobase(> = 2.5.5)
进口
链接
建议 GSEABaseGEOqueryorg.Hs.eg.dbhgu95av2.dblimma
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 GeneExpressionSignature
进口我
建议我 gskb
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 PGSEA_1.48.0.tar.gz
Windows二进制 PGSEA_1.48.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks) PGSEA_1.48.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/PGSEA/tree/release-3.4
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/PGSEA/
软件包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一: