要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“PGSEA”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
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此包适用于Bioconductor 3.4版;有关稳定的最新发布版本,请参见PGSEA.
Bioconductor版本:3.4
基因集富集的参数分析
作者:Kyle Furge < Kyle。furge在vai.org>和Karl Dykema < Karl。Dykema在vai.org>
维护者:Karl Dykema < Karl。Dykema在vai.org>
引文(从R内,输入引用(“PGSEA”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“PGSEA”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“PGSEA”)
R脚本 | HOWTO: PGSEA | |
R脚本 | PGSEA示例工作流 | |
参考手册 |
biocViews | 微阵列,软件 |
版本 | 1.48.0 |
在Bioconductor | BioC 2.0 (R-2.5)(10年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 2.10),GO.db,KEGG.db,AnnotationDbi,annaffy、方法、Biobase(> = 2.5.5) |
进口 | |
链接 | |
建议 | GSEABase,GEOquery,org.Hs.eg.db,hgu95av2.db,limma |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | GeneExpressionSignature |
进口我 | |
建议我 | gskb |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | PGSEA_1.48.0.tar.gz |
Windows二进制 | PGSEA_1.48.0.zip |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | PGSEA_1.48.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/PGSEA/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/PGSEA/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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