要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("SVAPLSseq")

在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。

SVAPLSseq

这个包是3.4版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见SVAPLSseq

svaplsseq -基于RNAseq数据的差异基因表达研究中调整变异隐藏因素的R包

Bioconductor版本:3.4

该软件包包含的功能是在调整了各种隐藏的生物和技术变异性因素后,用于从RNAseq数据中识别两组样品之间的差异表达基因。

作者:Sutirtha Chakraborty

维护者:Sutirtha Chakraborty

引用(来自R,输入引用(“SVAPLSseq”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源("//www.andersvercelli.com/biocLite.R") biocLite("SVAPLSseq")

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“SVAPLSseq”)

PDF R脚本 SVAPLSseq教程
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews BatchEffectGeneExpression归一化RNASeq软件
版本 1.0.0
在Bioconductor中 BioC 3.4 (R-3.3)(0.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.3)
进口 方法、统计数据SummarizedExperiment刨边机ggplot2limma航空航天平行,
链接
建议 BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

包的来源 SVAPLSseq_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 SVAPLSseq_1.0.0.zip
Mac OS X 10.9 (Mavericks) SVAPLSseq_1.0.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/SVAPLSseq/tree/release-3.4
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/SVAPLSseq/
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