要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)bioclite(“ seqgsea”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
此软件包适用于生物导体的3.4版;对于稳定的最新版本,请参阅seqgsea。
生物导体版本:3.4
该软件包通常通过整合差异表达和剪接来提供基因集富集分析的基因集富集分析。它使用负二项式分布来模拟读取计数数据,这说明了测序偏见和生物学变异。基于置换测试,也可以分别针对每个基因的差异表达和剪接来实现统计学意义。
作者:xi wang
维护者:xi wang
引用(从r内,输入引用(“ seqgsea”)
):
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要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ seqgsea”)
R脚本 | 使用SEQGSEA软件包对RNA-SEQ数据的基因集富集分析 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 差异性,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.14.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.12(R-3.0)(4年) |
执照 | GPL(> = 3) |
要看 | 生物酶,,,,多帕尔,,,,deseq |
进口 | 方法,Biomart |
链接 | |
建议 | EasyRnaseq,,,,基因组机 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | seqgsea_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | seqgsea_1.14.0.zip |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | seqgsea_1.14.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/seqgsea/tree/release-3.4 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/seqgsea/ |
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