要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“香草”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。

VanillaICE

这个包是3.4版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见VanillaICE

高通量基因分型阵列的隐马尔可夫模型

Bioconductor版本:3.4

隐马尔可夫模型在高通量SNP阵列中表征染色体改变。

作者:Robert Scharpf , Kevin Scharpf和Ingo Ruczinski < Ingo at jhsph.edu>

维护者:Robert Scharpf

引用(来自R,输入引用(“VanillaICE”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“香草”)

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“VanillaICE”)

PDF R脚本 crlmmDownstream
PDF R脚本 VanillaICE装饰图案
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CopyNumberVariation软件
版本 1.36.0
在Bioconductor中 BioC 2.1 (R-2.6)(9.5年)
许可证 LGPL-2
取决于 R (>= 3.0.0),BiocGenerics(> = 0.13.6),GenomicRanges(> = 1.19.47),SummarizedExperiment(> = 0.2.0)
进口 BiobaseS4Vectors(> = 0.9.25),IRanges(> = 1.14.0),oligoClasses(> = 1.31.1),foreachmatrixStatsdata.table、网格晶格、方法、GenomeInfoDbcrlmm,工具,统计,实用程序,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18
链接
建议 RUnitSNPchiphuman610quadv1bCrlmmArrayTV
SystemRequirements
增强了 doMCdoMPIdoSNOWdoParalleldoRedis
URL
这取决于我 MinimumDistance
进口我
建议我 CNPBayesoligoClasses
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

包的来源 VanillaICE_1.36.0.tar.gz
Windows二进制 VanillaICE_1.36.0.zip(32- & 64位)
Mac OS X 10.9 (Mavericks) VanillaICE_1.36.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/VanillaICE/tree/release-3.4
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/VanillaICE/
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