要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“香草”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包归档文件。
这个包是3.4版本的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本,请参见VanillaICE。
Bioconductor版本:3.4
隐马尔可夫模型在高通量SNP阵列中表征染色体改变。
作者:Robert Scharpf
维护者:Robert Scharpf
引用(来自R,输入引用(“VanillaICE”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“香草”)
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:
browseVignettes(“VanillaICE”)
R脚本 | crlmmDownstream | |
R脚本 | VanillaICE装饰图案 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CopyNumberVariation,软件 |
版本 | 1.36.0 |
在Bioconductor中 | BioC 2.1 (R-2.6)(9.5年) |
许可证 | LGPL-2 |
取决于 | R (>= 3.0.0),BiocGenerics(> = 0.13.6),GenomicRanges(> = 1.19.47),SummarizedExperiment(> = 0.2.0) |
进口 | Biobase,S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges(> = 1.14.0),oligoClasses(> = 1.31.1),foreach,matrixStats,data.table、网格晶格、方法、GenomeInfoDb,crlmm,工具,统计,实用程序,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 |
链接 | |
建议 | RUnit,SNPchip,human610quadv1bCrlmm,ArrayTV |
SystemRequirements | |
增强了 | doMC,doMPI,doSNOW,doParallel,doRedis |
URL | |
这取决于我 | MinimumDistance |
进口我 | |
建议我 | CNPBayes,oligoClasses |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。
包的来源 | VanillaICE_1.36.0.tar.gz |
Windows二进制 | VanillaICE_1.36.0.zip(32- & 64位) |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | VanillaICE_1.36.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/VanillaICE/tree/release-3.4 |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/VanillaICE/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
支持»
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